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特别推荐:蛋白纯化经验指南
作者:Chromatography 来源:weixingui@263.net 时间:2006-9-16

    165)chromatography,你好。我现在遇到一个非常头痛的事情,最近用分子筛SephadexG100来分离虾的总蛋白的时候可以把大分子和小分子蛋白分开,可是条件不变,换了蟹的材料就不行了,而且提高盐的浓度或PH值都没有使分离效果得到改善。请帮忙分析一下。分离条件如下:柱体积为80ml,流速为0.1ml/min,上样方式手工上样,缓冲液:0.05M磷酸缓冲液,PH=6.4。分离图谱和SDS电泳结果见附件。请问如果换一种孔径的分子筛是否能够使蟹总蛋白分离效果改善?如果是应该换大的还是小孔径的?您还有其他好的建议吗?谢谢了!

    要把大蛋白和小蛋白分开,那你干脆选择范围更小点的填料,例如G-50也许更好点,此外对凝胶过滤改变pH和盐对分离效果没有什么影响.你的流速也太慢了,可以提高到0.5ml/min左右.抱歉忽略了,以为已经回复过了呢. 

    166)还有一个问题想问一下。纯化的酶最终要冻干成制剂,静脉注射。可是内毒素很难合格,好不容易成功过几次,现在又不行了。而且我用的TRITON X-114萃取分离不适合放大。该酶理论等电点8.4。ph稳定范围7-11。肯定不能用阳离子柱了。内毒素合格标准每mg小于25EU。请问可以用什么方法,或者什么填料?哪可以提供少量填料小试一下(我们公司只有看到可行才会买大量柱料)?

    据我所知,内毒素的控制可以采取一下措施:
    1 首先所用的容器必须经过干烤,180摄氏度4小时以上,使粘附在容器上的内毒素分解。
    2 配制缓冲液的盐类必须保持不被内毒素污染。所用蒸馏水应该新鲜配制,所用试剂也最好新鲜配制,因为缓冲液在常温下很容易孳生细菌,而是溶液产生大量的内毒素。
    3 配制好的液体用0.22微米的滤器虑过。
    这样处理的话,有师兄将内毒素控制在了0.5EU/mg蛋白,符合FDA 的规定。
    不妨一试。
     
    你的酶是不是有同工酶,这酶有什么特点,需要辅酶吗,不知道有没有试过疏水,此外也可以用染料亲和的方法,不知道有没有可能用亲和的办法.
    萃取的方法回收率要低,而且如果临床那也得对你的的TRITON残留也是个问题,不好去干净.我们有专门去除内毒素的填料,可以给你点小样,你可以PM你的邮件给我,我把我们的材料发给你.我们是用亲和的方法,特异去除内毒素,收率高.你可以试试.

    167)我在纯化一个天然蛋白,纯化出来后没有抗原活性,请教原因。
    流程是这样:提取----conA柱-----DEAE柱(梯度洗脱)
    ---- -总蛋白 ---未结合部分 ---一个蛋白

    -与抗体 --反应 ----反应------- 不反应
    很是苦恼,最近才发现这个宝地,请不吝赐教。

    会不会是你的目标蛋白在最后一个柱子上有沉淀没有洗下来,或者失活了呢,你可以结合你的电泳图看看是不是把所有的蛋白都洗下来了,此外你的纯化工艺很有意思,第一步柱子好象没有太大意义,而且成本高,不如直接上离子交换看看.

    首先谢谢你的答复。第一步柱子是去掉大部分与conA结合的蛋白,然后在上的交换柱,文献上基本上都这样,而且电泳显示确实去掉了很多的蛋白。不过我将试试直接上离子柱的效果。
    电泳图显示的是除了最后纯化的蛋白外,几乎没有什么蛋白出来。离子交换柱不就是这种性质吗?我一直这样认为,蛋白挂在柱上,经过洗脱液洗脱得到自己的蛋白,没用的蛋白就洗不下来。不知对不对。

    conA应该是去除糖蛋白的,离子交换和别的色谱一样也是有穿透的,洗脱也有你的目标蛋白和别的杂质,没用的蛋白不一定都是洗不下来.现在关键是你的目标蛋白如果上离子交换也洗得下来,那没有活性会不会是你的蛋白失去活性,或者是你检测的方法有偏差,有没有可能是pH或者盐干扰抗原和抗体的结合呢.

    168)在层析过程中,我只是少量蛋白纯化,并且基本上是在4度层析柜中进行的,没有脱气,结果装柱装了几次,还是有一些气泡(开始在室温中装的,装好后放到层析柜中),由于样品已经处理好,最后一次有一些气泡我也没办法,我只能上样,结果在再平衡过程中出现很多峰,花了几个小时,还是没平衡,时不时又出现一个峰,真的很郁闷,这时我再看柱中的气泡时,几乎气泡都消失了,原来气泡一般都在柱壁上,是不是气泡跑到柱中间填料里去了?出现这么多峰,其它的问题都不存在,是不是气泡的缘故?如果装柱过程中有气泡,层析过程中会出现哪些情况?谢谢!

    造成这样的问题主要是因为由于你的液体和柱子中的液体有温差, 这样两种溶液混合的时候就容易产生气泡, 你最好把你的溶液脱气,同时保持管道以及你的溶液温度都差不多,也就是液体也放在层析柜中,这样会好些,你说的问题说明的确是有气泡,气泡不是进入填料中间,而是出去了,或者变更小了,一直出到检测池中,所以一直有小峰上去又很快下来,装柱子装好后再放到层析柜中也不会有气泡的,主要还是有温差造成的,如果柱子中有气泡有两种情况,一是气泡一直不断,有气泡也赶不走,二是可以把气泡赶走,但是越多越难赶,因此最好是没有气泡,否则柱子分离效果也不好。

    你说的情况似乎跟我的不一样,我装柱的时候,液体都放在层析柜里,并且恒流泵也放在层析柜中,柱中都是刚从层析柜中拿出来的,还有,我的很多峰并不像你说的那样上去又很快下来,慢慢上去,下得也很慢,持续的时间相当长,不知为什么?很急,做得很烦,是不是填料有问题?

    气泡出的快慢和流速有很大的关系,流速慢,气泡比较大,所以上得慢,下来也慢,无论如何我觉得都是气泡的事,尽量要避免有温差.柱子中装的时候一定要没有气泡,否则很难赶走.
     
    169)我这几天作DEAE sephadex 50离子交换,上样前检测有蛋白,但是洗脱梯度0.1mol/L到1mol/L。但是检测没有任何蛋白(280nm),实用的缓冲液tirs-Hcl 8.0
    样品是碱性蛋白酶。不知道什么原因?谢谢!!

    那你用更高的盐,如2M做个梯度你看看怎么样.也许你的蛋白要更高浓度的盐才能洗下来.

    170)我有一个问题:我们的蛋白原来是用CM填料纯化的,洗脱条件都已经摸索好,最近我觉得我们CM填料有问题,我们还有SP填料,我想请问一下,如果我用SP填料的话,用CM填料的洗脱条件是否适用?能否得到相同的结果?
    还有一个小问题:
    使用分子筛时,每一种填料都有一个分级范围,我想请问一下,洗脱体积跟洗下来的蛋白的分子量之间的具体关系是怎样的?就是说,比如Sephadex G-25 的分级范围在1000~5000,多少柱床体积,分子量1000的蛋白分子就出来了?一般洗几个柱床体积就可以了?谢谢!
    1.我觉得你换填料,那么条件一般是不会一样的,还得再摸一下条件,如果你是用线性梯度洗脱的方式,那直接重复看看就可以.反正都得做了才知道.
    2,很难把握不同蛋白的洗脱体积,因为和你的蛋白特性,浓度,上样量流速等都有关系,做纯化还是得有检测器的,毕竟和除盐不一样.

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