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特别推荐:蛋白纯化经验指南
作者:Chromatography 来源:weixingui@263.net 时间:2006-9-16

    96)1、我们用CM52大量纯化某蛋白,经常会碰到介质裂缝,不知什么原因?
    2、离子交换层析时柱高/直径的值有很高要求吗?如果为5/7会对分离有很大影响吗?用PB或ABS平衡时你们一般用多少柱床体积?
    3、我们用5KD超滤浓缩后蛋白的损失很大,能否帮忙分析一下原因(PALL 的超滤器)?

    那也许是因为有气泡,累积到一定地步后就穿过介质所以裂缝,你流速不能太快,而且缓冲液脱气,这样就应该好了.
    2.一般离子交换没有必要算什么高/直径比,一般用的短粗柱子,亲和和疏水也都是这样的就可以,没有刻意要求,5/7应该影响也不大,当然如果你走线形梯度洗脱,也适当把这个比值增加点,如果走阶段洗脱就没有关系。
    3。超滤膜本身的面积不小,这样也会吸附蛋白,特别是处理的量比较小的情况损失会很明显,如果量大,那损失会小的,此外如果蛋白不耐剪切力,那么用这样的方法浓缩也要特别小心,因为失活会很明显的。

    97)我做的是原核表达蛋白质,目的蛋白是一个GST-融合蛋白,现在通过SDS-PAGE电泳发现目的条带已经表达出来了,正在做纯化,但是过柱纯化后发现还有其他的几条带,应该只有目的条带的,我就按照分子克隆上说的在过柱前加了点triton-100,但再做电泳发现杂带还有几条,但目的条带却不见了,
    1.为什么目的条带不见了?
    2、下一步应该怎么办呢?
    如果你的有一些别的杂带,那么你可以在清洗的时候多洗几个床体积,此外可以用还原谷胱甘肽做阶段洗脱,你试试,此外加大上样的流速,缩短作用时间,在你的平衡缓冲液中加点盐减少非特异吸附,你的带不见了,可能是
    triton-100干扰结合,所以不能用,你用吐温也试试看,因为这个纯化特异性是比较高的,除非你的蛋白有降解现象,你可以用抗体做WB检测看看是不是都是你的目标蛋白,总之修改的方案就是我说的这几个,摸索一下吧。
    此外可以选择作用力更弱点的填料。这样特意性更好。
     
    98)手头有碱性磷酸酶的资料吗?能否告诉我它的详细结构 我想提纯 谢谢拉
    最好还可以告诉我想关的提纯方法!它存在于细胞壁与膜之间,大概80K(四聚体)、32KD(二聚体),它耐高温80度仍然保持活性(在有镁离子存在的情况下),最适PH8.0
    我现在已粗步提取下步想层析, 你看该选择什么材料填柱
    蛋白没有什么详细的结构吧,至于纯化它既然是碱性的蛋白,那你可以直接用阳离子柱子做粗步纯化,此外既然它能耐受80度,那你这样处理,大多的杂蛋白就沉淀了被去除,再上离子交换就应该有不错的效果。
    填料可以选择CM琼脂糖凝胶和SP琼脂糖凝胶。
     
    99)前几天我提取了一种菊科植物的蛋白,用的是tris—Hcl缓冲液,然后用100%丙酮沉淀蛋白,结果蛋白中含有色素杂质,属水溶性,颜色很深,请教高手,如何除去色素干扰,纯化蛋白?另外我也查了一些资料,说可能是花色素,于是我在100%丙酮沉淀后,加了一步0.1%甲醇,但是并没有显著的效果。
    你说的花色素就是黄酮类的花青素吗,它有很强的亲水性,所以丙酮沉淀它也沉淀,你可以改用乙醇沉淀或者硫酸铵沉淀,这样色素就不会被沉淀了,你试试吧。

    100)用PB(pH6.8)或ABS(pH4.0)平衡时你们一般用多少柱床体积?10X够了吗?
    一般也就3-5个床体积吧,离子交换需要平衡体积大点也,10X足够了

    101)有个关于胰岛素精纯化的问题想向你请教,我已取得95%纯度样品。但杂质大于1%,进一步纯化,用什么柱子,具体操作又怎样做呢,谢谢赐教。
    我知道,我好象回复过,你用反相硅胶10um的柱子1.0X25cm或者2.2X25cm的柱子做制备,这样可以达到99%以上的纯度,别的方法很难做到你需要的纯度,此外胰岛素也可以用等电点沉淀的办法去掉一些杂质。

    HPLC制备你可以参考相关的文献,其实也就是甲醇水或者乙腈水含三氟乙酸,先是低浓度吸附,然后提高浓度洗脱,详细的条件和你做反相纯化是一样的,只是HPLC的分离效果更好。
    102)请问怎样可以查到protein的PI值?,多谢了先!
    已知的蛋白当然是查资料,未知的如果知道序列的话,可以用软件,你在论坛中搜索吧,有不少帖子的.
    103) 谢了chromatography兄,也就是必需用小颗粒的硅胶填料了。
    是的,需要用HPLC做制备,或者你优化的你工艺,看能不能提高纯度.

    104)chromatography兄:
    非常感谢回复,我手里也有一个GST融合表达的项目,经纯化后,用EK酶切时,出问题了。
    目的蛋白是12KD左右,PI约PH9.5。用PH8.0,0.1M NACL条件酶切时,反应液发混,全部沉淀,切出的蛋白(约12KD)经尿素溶解,透析后,PH6.0不能挂上CM柱。用PH8.0,2mM CaCl2条件酶切时,也有发混,但目的蛋白有14KD左右,PH6.0可以挂上CM柱。不知是不是酶切条件有问题?
    另外,chromatography兄,有化学破菌及EK酶切相关文献吗?给我发一份好吗,E-mail:zhangxstc@yahoo.com.cn
    别客气,有沉淀也许是蛋白在那样的pH下溶解度不好,或者因为缓冲液的原因,挂不住会不会是没有切开,所以挂不柱.最好用电泳看看切的效果如何.
    至于破碎我不很清楚,酶切你可以参考下面的东西:
    http://www.ls.huji.ac.il/~purification/Purification_Protocols.html#Cleavage_Sites_Table_for_Fusion_Proteins

    105)我想用DEAE纤维素来做填料
    我的粗提酶液蛋白含量大约为7mg/ml我该选择哪个型号的DEAE呢?

    DEAE纤维素要是同一家公司的差别不大,最常用的也就是DEAE纤维素 DE-52,其实我觉得你还是选择DEAE琼脂糖凝胶,流速也快,好用,没有什么必要一定用纤维素,何况价格也不便宜.你做的是什么酶呢.

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