现代DNA分子标记具有广阔的应用前景，虽有不足，但与形态标记、同工酶标记、染色体标记相比有许多优点，因此，DNA分子标记具有更高的可靠性和高效性，更容易从分子水平上研究物种亲缘关系、种子资源保存等。 DNA分子标记也为生物多样性研究提供可靠有力的证据。但是由于物种多样性、遗传多样性、环境多样性的影响，对于不同的生物体不可能采取一套统一的方法进行研究，应具体问题具体分析。
PCR技术在植物分子生物学中的应用
PCR—聚合酶链式反应（polymerase chain reaction）是项体外特异复制特定DNA片段的核酸合成技术，这项技术是分子生物学研究领域的一次创举。该技术自Kary Mullis（1984）发明以来，已出现了多种改型和改进。
进行PCR时，通常需要合成两个待扩增片段两侧的寡聚核苷酸引物，这些引物分别与待扩增片段的两条链互补定向，使两引物之间的区域得以通过聚合酶而扩增。
PCR扩增过程：
