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电泳、转膜
作者:未知 来源:生物秀 时间:2006-9-9
    转膜是把DNA从琼脂糖凝胶中转移到固相支持物(一般是尼龙膜)上固定,是进行各种后续研究(如RFLP分析,阳性克隆的筛选验证等所有涉及分子杂交的研究)的前提。
     
    实验目的:掌握Southern blotting的原理及操作步骤
    实验原理:
    1. 转膜的方式:
    向上的毛细管转移
    向下的毛细管转移
    同时向两张膜转移
    电转移
    真空转移
    2. 固相支持物的种类及选择:
    硝酸纤维素膜:非共价结合,易脆,易丢失DNA,< 500 bp的DNA无效,转膜前的工作(从提高转膜效率,利于转膜后使用等)
    尼龙膜(带正电荷的)高强度,不易破损,具有较大的DNA结合容量,它能够吸附变性DNA,核酸以共价结合方式不可逆的结合在尼龙膜上。尼龙膜两边均有同样吸附DNA功能,无论用哪边均可以经久耐用,可反复利用10次以上(10-20次),经毛细管(毛细吸附)作用,把DNA从凝胶上转到膜上。DNA转到膜上是复制胶上的带型,在80-100℃真空干燥2-4 hrs,即可固定DNA。    
    3. 转移缓冲液(transfer buffer)的选择:
    带正电荷的尼龙膜:可用高盐离子强度(SSC),但不能充分发挥膜潜能;0.4N NaOH,共价结合DNA是最大优点。
    硝酸纤维膜:高盐离子强度促进DNA与膜结合(20×SSC),低盐离子强度导致小片段DNA在转移过程中丢失,pH>9,DNA不能与膜结合。
    4.转膜时间(duration of transfer)约12 hrs
    效率高低,但已无补救措施,因此,每一步应严格操作。
    实验材料及试剂:酶消化好的DNA样品,尼龙膜,0.2N HCl,0.4N NaOH等    
    实验步骤:
    1. 0.8%琼脂糖电泳
    制胶:注意琼脂糖的质量,胶的浓度,厚度(<5mm)及均一性。一般大电泳槽配制250ml 0.8%琼脂糖凝胶,采用42孔梳子(经济,高效)
    制样,点样:DNA样品中指示剂量稍多
    电泳:一般1-1.5V/cm的电压, 使DNA迁移到适当距离,一般指示剂约移动10-11cm (大电泳槽:40V×12-15hrs,小电泳槽30V×4-5 hrs)
    2.转膜前的准备:
    依胶大小每块凝胶准备两张比胶稍大的滤纸(11×12.5 cm),两张用作盐桥的滤纸,一张与胶同样大小的尼龙膜(10×10.5cm),两个玻璃盘、两块有机玻璃板、一根玻璃棒,比尼龙膜稍大的一叠吸水纸等。
    3.一玻璃盘中加入足量的0.4N NaOH,放上洗净的玻璃板,按图示搭制盐桥(操作示范)。
    4.凝胶的预处理:
    a)      从电泳槽中移出凝胶置于塑料板上,用切胶板把胶切成适当大小,切去右上角(最后一个样品的最前端)作为电泳方向记号
    b)      把凝胶翻面,放入加有足量的0.2N HCl玻璃盘中,轻轻摇动10min,使指示剂变黄色为止(脱嘌呤)
    c)      倒去HCl溶液,加蒸馏水漂洗凝胶
    d)      倒去蒸馏水,加0.4N NaOH中和
    e)      同时在盐桥滤纸上洒些0.4 NaOH,立即将胶放在盐桥上(忌气泡)
    5.胶的四周用塑料片与胶紧紧相连,防止短路(吸水纸与盐桥相接)
    6.在胶面上倒足够量0.4N NaOH,小心放置膜(预湿0.4N NaOH)使膜覆盖整块胶(要求一次成功,不能移动)
    7.膜上放2张滤纸,滤纸大小为15×12cm
    8.放不少于5cm厚的吸水纸,放上玻板,其上压约500g的重物,转膜12 hrs左右 
    9.转膜完毕,用2×SSC漂洗膜两次,各五分钟。用EB染胶以检测转移效果。
    10.用两张滤纸包住膜,置于80-100℃的真空干燥箱中,干燥2-4 hrs。
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