3. 分离纯化质粒DNA
(1)加入150μl冷却的乙酸钾溶液。加盖后,温和颠倒数次混匀,冰浴放置15min。
(2)4℃下离心,12000r/min, 5min,乙酸钾能沉淀SDS与蛋白质的复合物,并使过量的SDS-Na+转化为溶解度很低的SDS-K+一起沉淀下来。离心后,上清液若仍混浊,应混匀后再冷至0℃,重复离心。上清液转移至另一干净的Eppendorf管内。
(3)加入等体积的酚/氯仿饱和溶液,反复振荡,离心,12000r/min, 2min,小心吸取上层水相溶液,转移到另一个Eppendorf管中。
(4)上述溶液中加入两倍体积的预冷无水乙醇,混合摇匀,于冰上放置10min。4℃下离心,12000r/min ,5min, 弃去上清液,并将Eppendorf管倒置在干滤纸上,空干管壁粘附的溶液。
(5)加入1mL 70%冷乙醇,洗涤沉淀物,离心,弃去上清液,尽可能除净管壁上的液珠,放置干燥或真空干燥,即得质粒DNA制品。
(6)将DNA沉淀溶于20μlTE缓冲液(临用前加入20μg/mLRNaseA),置-20℃保存,备用
注意事项
(1)细菌培养过程要求无菌操作。细菌培养液、配试剂用的蒸馏水、试管和Eppendorf离心管等有关用具和某些试剂经高压灭菌处理。
(2)制备质粒的过程中,所有操作必须缓和,不要剧烈振荡,以避免机械剪切力对DNA的断裂作用。
(3)加入乙酸钾溶液后,可用小玻璃棒轻轻搅开团状沉淀物,防止质粒DNA可能被包埋在沉淀物内,不易释放出来。
(4)用酚/氯仿混合液除去蛋白效果比单独使用更好,为充分除去残余的蛋白质,可以进行多次抽提,直至两相间无絮状蛋白沉淀。
(5)提取的各部操作尽量在低温条件下进行(冰浴上)

