(一) 转基因植株的PCR检测
1 植物基因组DNA的提取
1) 取4 g植株，在液氮中研磨成粉末(越细越好)。
2) 转移至50 ml 离心管中，加入16 ml 提取液，充分混匀。65℃水浴保温20 min。
3) 加入5ml 5M KAc溶液，冰浴放置30min以上。
4) 加入5ml氯仿：苯酚(1﹕1)，混匀。6000rpm离心10min。
5) 上清液转移到一个干净的5mL离心管中，加入5ml氯仿，6000rpm离心10min
6) 上清液转移到一个干净的5mL 离心管中，加入等体积冰冻的异丙醇。-20℃放置2h以上，沉淀DNA。4℃，6000rpm离心10min。弃上清液。
7) 用70％乙醇洗涤沉淀2～3 次，吹干。
8) 沉淀用TE 缓冲液溶，用分光光度法测A260及A280以确定浓度，于-20℃贮存备用。
2 根癌农杆菌质粒提取
1) 将3ml农杆菌菌液倒入离心管中，7, 000rpm离心1min。去掉上清液，沉淀悬于200μLSolution I 中。
2) 加入300μL Solution II，混匀，冰浴5min。
3) 加入300μL Solution III，混匀，冰浴5min。
4) 加800μL氯仿，混匀，13, 000rpm离心15min，取上清液。
5) 上清液中加入预冷的等体积异丙醇，-20℃沉淀30min。
6) 13,000rpm离心15min。去上清，沉淀加入500μL 70%乙醇洗涤2 次。
7) 13,000rpm离心3 分钟，去乙醇。
8) 每管中加入38μL无菌水2μLRNase, 37℃消化。
9) 电泳检测质粒，用分光光度法测A260及A280 以确定浓度，于-20℃贮存备用。
3 PCR扩增
1) PCR反应液
取转基因植物、对照植物和根癌农杆菌质粒DNA(0.01～0.5μg)作PCR反应模板，每个离心管中加入50μL反应混合液。反应混合液包含：
并设两个空白对照，即分别没有DNA和没有引物。
2) PCR扩增
先95℃预变性5min，然后进行下列循环： 95℃变性30 sec，55℃退火30 sec，72℃延伸30 sec，40 个循环。最后，72℃延伸10min。
3) PCR扩增产物的检测
PCR 完毕后，取5μL 扩增产物在1.5%的琼脂糖凝胶上电泳，电压为5 伏/cm，电解缓冲液为1×TAE(40mmol/L Tris-乙酸，1mmol/L EDTA)，凝胶中含有0.05%的溴化乙锭，以PCR Markers作为分子量标记，在紫外透射仪上观察并照像记录。
(二) 转基因植株的Southern检测
转基因植株DNA提取同上，选用在SsNHX1基因序列中没有酶切位点的限制性内切酶BamH I进行酶切。杂交膜的制备、探针的制备和杂交过程等具体操作方法见《分子克隆实验》。
