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Northern杂交
作者:梁旭方 方玲编写… 来源:生物秀 时间:2006-9-4

    变性RNA的转移和固定:
    (1) 将凝胶转移至培养皿中,用锋利的刀片修去凝胶的无用部分,在凝胶的左上角切取一角作为标记。
    (2) 将凝胶置于0.5×TBE中平衡30min。
    (3) 用切纸刀裁一张长宽均大于胶1mm 的尼龙膜,切去膜一角,使其与凝胶的切角对应。
    (4) 将尼龙膜和6 张与胶大小一致的滤纸置于0.5×TBE中平衡10min。
    (5) 将3 张滤纸平铺于电转移装置的金属箔片上(阳极),用玻棒赶走所有气泡。
    (6) 将已平衡的尼龙膜平铺于滤纸上,用玻棒赶走所有气泡。
    (7) 小心将凝胶置于尼龙莫上,并使两者的切角相重叠,确保胶与膜之间没有气泡。
    (8) 将另外3 张滤纸置于胶上,用玻棒赶走所有气泡。
    (9) 于最上层加入约15ml转移缓冲液(0.5×TBE)以湿润滤纸。
    (10) 将支持框至于胶/膜/滤纸四周,接上阴极电极,盖上安全盖,接上电源供给装置(确保电极插 头连接正确),给予3mA/cm2 的恒流,转移时间一般为30-35min(电转过程中,电压保持在20V左右,若超过25V,则须终止转移)。
    (11) 电转结束后,用2×SSC 漂洗尼龙莫。
    (12) 将尼龙莫置于一张干的滤纸上,在波长254nm 处按照0.120J/cm2 的剂量照射3min。
    2. 杂交
    1)试剂
    DIG Easy Hyb
    2)方法

    (6) 将变性的DIG 标记的DNA 探针加入预热的DIG Easy Hyb(3.5ml/100cm2膜)。小心
    混匀,避免产生泡沫。
    (7) 开泵排走预杂交液。
    (8) 关泵,等到负压消失,加入上述探针/杂交液,温育至少6h。
    开泵排走DNA 样品溶液(注意:每次开泵应完全抽走薄膜上的试剂)。注:杂交温度因
    不同探针而异。
    3. 洗脱
    (1) 用2×SSC,0.1% SDS于15-25℃洗脱2次,每次5min。
    (2) 用0.5×SSC,0.1% SDS 于65-68℃洗脱2 次,每次15min。
    4. 显色
    1)材料
    DIG-labeled 核苷酸
    2)试剂
    (1) Washing buffer: 0.1M Maleic acid, 0.15M NaCl; ph7.5 (20℃); 0.3% (v/v)Tween20
    (2) Maleic acid buffer: 0.1 M Maleic acid, 0.15M NaCl; 用NaOH(固体)调节pH到7.5 (20℃)
    (3) Detection buffer: 0.1M Tris-HCl, 0.1 M NaCl, ph9.5 (20℃)
    (4) TE buffer: 10mM Tris-HCl; 1mM EDTA; pH 8.0
    (5) Blocking stock solution: 用Maleic acid buffer 将Blocking reagent 稀释为10%(w/v)
    (6) Blocking solution: 用Maleic acid buffer 将10× Blocking reagent 稀释为1×working solution
    (7) Antibody solution:每次使用前将Anti-Digoxigenin-Ap, 10000rpm 离心5min, 用Blocking solution将Anti-Digoxigenin-AP 稀释5000倍
    (8) Color substrate solution: 于10ml Detection buffer 贮藏液中加入200μlNBT/BCIP(避光保存)
    3)方法:
    (1) 把杂交仪温度调至25℃。
    (2) 杂交后按严格的步骤洗脱后,用Washing buffer 简单的清洗。
    (3) 于100ml Blocking buffer 中保育30min。
    (4) 在20ml Antibody solution 中保育30 min。
    (5) 用100ml washing buffer 洗2*15min。
    (6) 在20ml Detection buffer 中平衡2-5min。
    (7) 在黑暗的合适的容器中,将膜于10ml 新鲜配制的Color substrate solution 中保育0.5h-16h (该过程不要摇动,可一段时间的暴露灯光下观察染色情况)。
    (8) 当所需的颜色呈现时,用50ml 灭菌的双蒸水或TE-buffer冲洗膜。

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