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RNA 的制备与分析
作者:未知 来源:生物秀 时间:2006-8-30


    α-32P cDNA探针标记:

    (1)取模板DNA 25ng在离心管中。变性,冰浴。

    (2)dNTPmix制备:dGTP、dATP、dTTP等量混合。

    (3)将下列反应成份混合,加入上述离心管中: dNTPmix  2.0μl、 BSA 1.0μl、  5×Buffer 5.0μl、 Klenow 酶1.0μl、  α-32P-dCTP  2.5μl。

    加入双蒸水适量,使反应总体积达25μl,轻轻混匀。室温下反应1小时。

    预杂交:
    常用的封闭物:
    (1)变性的非特异性DNA:鲑鱼精子DNA;小牛胸腺DNA
    (2)高分子化合物:Denhardt‘s溶液(含葡聚糖、聚乙烯吡咯烷酮、牛血清白蛋白等)。

    杂交:
    (1)离子强度:6×SSC
    (2)DNA探针长度
    (3)温度:低于Tm(熔解温度)15-25℃
    (4)时间:16小时

    洗膜

    压片

    膜的重复使用

    (三)原位杂交:
    原理:含有互补顺序的标记DNA或RNA片段(探针),在适宜的条件下与细胞内特定的DNA或RNA形成稳定的杂交体。

    应用:观察目的基因或mRNA 在细胞中的定位;半定量分析其含量变化。
    直接法:用放射性同位素、荧光素、酶标记的探针与细胞内靶核苷酸形成杂交体,通过放射自显影、荧光显微镜或成色的酶促反应直接显示结果
    间接法:用半抗原标记探针,最后采用免疫组织化学法对半抗原定位,间接显示探针与靶核苷酸形成的杂交体。
    方法:
    1、玻片:
    洗→酸处理→冲洗→烤→粘附剂
    常用的粘附剂:多聚赖氨酸、明胶、3-氨丙基三乙氧硅烷(APES)。
    原位杂交专用玻片。
    2、取材、固定:
    (1)保持细胞结构;(2)最大限度地保持细胞内DNA或RNA的水平;(3)使探针易于进入细胞或组织。



    3、组织切片的处理:
    (1)脱蜡:石蜡影响探针的穿透性。
    (2)去污剂处理:增加组织通透性。
    (3)蛋白酶消化:使经固定后被遮蔽的靶核苷酸探针的杂交能力。
    (4)酸酐和酸处理:防止探针与组织中碱性蛋白之间的静电结合,以降低背景。
    (5)杂交缓冲液孵育:阻断载玻片或组织标本中可能与探针产生非特异性结合的位点,以降低背景。
    (6)内源性生物素和酶的抑制:防止假阳性。

    4、杂交:
    (1)探针长度:以50-300bp为宜。
    (2)探针变性:95℃,5-10分钟。
    (3)探针浓度:
          放射性同位素: 0.5ng/μl;
          非放射性同位素2ng/μl。
    (4)杂交温度:应低于杂交体融解温度(melting temperature, Tm)20-30℃。
    (5)杂交时间:18-24小时。


    5、杂交后处理:
        去除未参予杂交体形成的过剩的探针,除去探针与组织标本之间的非特异性结合,以降低背景。
    6、对照试验
          阳性、阴性、组织对照。

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