α-32P cDNA探针标记:
(1)取模板DNA 25ng在离心管中。变性,冰浴。
(2)dNTPmix制备:dGTP、dATP、dTTP等量混合。
(3)将下列反应成份混合,加入上述离心管中: dNTPmix 2.0μl、 BSA 1.0μl、 5×Buffer 5.0μl、 Klenow 酶1.0μl、 α-32P-dCTP 2.5μl。
加入双蒸水适量,使反应总体积达25μl,轻轻混匀。室温下反应1小时。
预杂交:
常用的封闭物:
(1)变性的非特异性DNA:鲑鱼精子DNA;小牛胸腺DNA
(2)高分子化合物:Denhardt‘s溶液(含葡聚糖、聚乙烯吡咯烷酮、牛血清白蛋白等)。
杂交:
(1)离子强度:6×SSC
(2)DNA探针长度
(3)温度:低于Tm(熔解温度)15-25℃
(4)时间:16小时
洗膜
压片
膜的重复使用
(三)原位杂交:
原理:含有互补顺序的标记DNA或RNA片段(探针),在适宜的条件下与细胞内特定的DNA或RNA形成稳定的杂交体。
应用:观察目的基因或mRNA 在细胞中的定位;半定量分析其含量变化。
直接法:用放射性同位素、荧光素、酶标记的探针与细胞内靶核苷酸形成杂交体,通过放射自显影、荧光显微镜或成色的酶促反应直接显示结果
间接法:用半抗原标记探针,最后采用免疫组织化学法对半抗原定位,间接显示探针与靶核苷酸形成的杂交体。
方法:
1、玻片:
洗→酸处理→冲洗→烤→粘附剂
常用的粘附剂:多聚赖氨酸、明胶、3-氨丙基三乙氧硅烷(APES)。
原位杂交专用玻片。
2、取材、固定:
(1)保持细胞结构;(2)最大限度地保持细胞内DNA或RNA的水平;(3)使探针易于进入细胞或组织。

3、组织切片的处理:
(1)脱蜡:石蜡影响探针的穿透性。
(2)去污剂处理:增加组织通透性。
(3)蛋白酶消化:使经固定后被遮蔽的靶核苷酸探针的杂交能力。
(4)酸酐和酸处理:防止探针与组织中碱性蛋白之间的静电结合,以降低背景。
(5)杂交缓冲液孵育:阻断载玻片或组织标本中可能与探针产生非特异性结合的位点,以降低背景。
(6)内源性生物素和酶的抑制:防止假阳性。
4、杂交:
(1)探针长度:以50-300bp为宜。
(2)探针变性:95℃,5-10分钟。
(3)探针浓度:
放射性同位素: 0.5ng/μl;
非放射性同位素2ng/μl。
(4)杂交温度:应低于杂交体融解温度(melting temperature, Tm)20-30℃。
(5)杂交时间:18-24小时。
5、杂交后处理:
去除未参予杂交体形成的过剩的探针,除去探针与组织标本之间的非特异性结合,以降低背景。
6、对照试验
阳性、阴性、组织对照。

