细胞裂解不充分, 裂解液和样品要快速充分混匀。
◆ 洗脱产物DNA量很少或没有：
1. 样品中细胞或病毒浓度低。
2. 裂解液和样品混合不均匀造成的细胞裂解不充分。
3. 蛋白酶K活性下降造成的细胞裂解不充分。
4. 温浴时间不够造成的细胞裂解不充分或蛋白降解不完全，尽量把组织切成小块，延长温浴时间，使裂解物中没有颗粒状物残留。
5. 在上柱前，裂解物中没加乙醇，或用低浓度乙醇代替无水乙醇。
6. DNA没有有效洗脱，提高洗脱效率，可将离心柱在加入洗脱液后在室温静置至少1 min，再离心。
7. 洗脱液pH不合适，低pH值会减少DNA产率。确保洗脱液pH值在7.0－8.5之间。
8. 洗脱体积太大，超过200μl洗脱体积所得的DNA浓度会降低，但DNA总量不会减少。
◆ A260/A280 比值较低：
用水作为洗脱液时，比值偏低。
◆ A260/A280 比值较高：
大量RNA残留，没有使用RNase A，或RNase A活性下降。
◆ DNA影响后续酶反应实验：
1. 在洗脱液中有残留的漂洗液GW，可通过再次离心去除硅胶膜上的GW。
2. 大量RNA残留。
◆ 在缓冲液GA、GB中有白色沉淀：
白色沉淀可能由于低温或长时间放置产生，可在使用前在56℃重新加热溶解。
◆ 在操作中加入缓冲液GB有白色沉淀：
在缓冲液GB加入后产生的白色沉淀在70℃温浴时会消失，不会影响下游操作。
