制作平板胶:
分离胶的配制方法:
药品/浓度 5% 7.5% 10% 12.5% 15%
丙烯酰胺 6.7ml 10ml 13.3ml 16.7ml 20ml
分离胶缓冲液 10ml 10ml 10ml 10ml 10ml
10×SDS 0.4ml 0.4ml 0.4ml 0.4ml 0.4ml
无菌水 22.7ml 19.4ml 16.1ml 12.8ml 9.5ml
10%过硫酸胺* 200vl 200vl 200vl 200vl 200vl
TEMED* 13.3vl 13.3vl 13.3vl 13.3vl 13.3vl
*在灌胶之前加入
药品配制:
丙烯酰胺单体储液:丙烯酰胺60g甲叉双丙烯酰胺1.6g溶于无菌水中总体积200ml分离胶缓冲液:Trisbase181.5g 溶于750ml 无菌水中调PH8.8总体积1000ml10%SDS:SDS5g溶于无菌水中总体积50ml10%的过硫酸胺:0.1g溶于无菌水中总体积1mlSDS 电泳缓冲液:Trisbase15.1g甘胺酸72.1gSDS5g溶于无菌水中总体积5000ml
封胶溶液:SDS电泳缓冲液100ml 琼脂糖0.5g溴酚蓝少许附:蛋白质含量测定的方法(Bradford 方法)
原理:这一方法基于2 考马斯亮蓝G-250 有红蓝两种不同的形式。在一定浓度的乙醇及酸性条件下,可配成淡红色的溶液,当与蛋白质结合后,产生蓝色化合物,反应迅速而稳定。反应化合物在465-595nm处有最大的光吸收值,化合物颜色的深浅与蛋白浓度的高低成正比关系,因此可检测595nm的光吸收值的
大小计算蛋白的含量。
溶液:
1)Bradford储存液
100ml95%乙醇
200ml88%磷酸
350mgServaG蓝
室温下长期保持稳定。
2)Bradford工作液
425ml双蒸水
15ml95%乙醇
30ml88%磷酸
30ml Bradford储存液
用滤纸过滤,保存于室温棕色瓶中,可保存数周,但在使用前需要过滤。
3)配制1mg/ml牛血清蛋白(BSA)
做标准曲线:
取样品即可测量。
注意事项:
1、样品的问题:
样品制备是做好2-d 的关键,这句话好象有点多余,如果样品中离子浓度过大,根本做不了2d,我开始的时候由于提取方法有问题,结果浪费了很多时间和IPG胶条,真的很心痛呀!另外再说明一点,最好用新鲜的样品提取蛋白质,蛋白点的差异很大,新鲜的样品点多,而我用存放在-80 的样品跑出来效果差了很多呀!如果你不确定你的蛋白提的如何,建议你先跑sds-page。检验一下。关于蛋白的提取方法,我还想听听各位的建议。
2、上样量的问题,我觉得我跑的这张2D 图,上样量还需要调整,可以适当降低,我的ipg 胶条是13 厘米的上样量在50ng-80ng之间,上样量不合适,丰度低的将会被丰度高的所遮盖,这是最讨厌的问题。
3、跑一向的时候大家都差不多,根据公司的说明就可以做了。跑二向的时候我现在一般做恒压,以前做过恒流,没感觉有什么差异,还想请教各位!横流和恒压到底哪个更好一些!
4、ipg 胶条ph 的选择,我做的是植物的花药,一般情况下酸性端点多一点,碱性端较少,我现在选用的是ph3-10 的,我觉得很不合适,(不过这个胶条是免费的)因此好多点没能很好的分开,如果胶条的ph小一点,胶条(我希望能达到18cm)可是我们这里做不了,效果应该比这个好很多的!
5、从这块胶上,我觉得致命点就是背景深,将影响我下一步的分析。所以银染还需要改进!
6、针对不同的蛋白质,分离胶的浓度也是可以调节的,我比较懒,就作过10%,12.5%的,不过觉得都不
适合。


