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碱变性法提取质粒DNA
作者:未知 来源:沈阳药科大学 时间:2006-8-10

    实验目的
        提取基因工程中运载基因的载体,掌握最常用的提取质粒DNA的方法。 
     
    实验原理
        碱变性提取质粒DNA是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离目的。在pH高达12.6的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开而变性。质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会完全分离,当以pH4.8的NaAc高盐缓冲液去调节其pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复原来的构型,保存在溶液中,而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。 
     
    实验材料和试剂
        (一)实验材料
         大肠杆菌DH-5a(pUC118)(使用实验一转化平板上的菌)。
        (二)培养基和试剂
        1. LB液体培养基
           同实验一。
        2. 抗生素:氨苄青霉素(ampicillin, Amp),配制成100mg/ml备用。
        3. 溶液I : 
               50mmol/L   葡萄糖
               25mmol/L   Tris-HCl(pH8.0)
               10mmol/L   EDTA(pH8.0)
                2mg/ml     溶菌酶
         4. 溶液II : 
               200mmol/L  NaOH
               1%         SDS
        5. 溶液III :
                3mol/L     NaAc(pH4.8)溶液
        6. TE缓冲液 :
                10mmol/L   Tris-HCl(pH8.0)
                 1mmol/L   EDTA
        7. 预冷的无水乙醇
        (三)器材
        接种针                      1ml移液管                                               
        1.5ml Eppendorf管            200ml吸头                   
        冰块                        牛皮纸
        纱布盖                      线绳
        (四)仪器
        微量移液器                  涡流混合器
        低温高速离心机 
     
    实验步骤
        1.取100mg/ml的氨苄青霉素20ml 加入到20ml LB液体培养基(20ml/250ml三角瓶)中,使氨苄青霉素的含量为100mg/ml,分装到5×150mm试管中,每管3ml。分别挑取实验一转化平板上的单菌落,接种到含有100mg/ml氨苄青霉素的LB液体培养基(3ml/试管)中(每组挑2个菌落)。37℃振荡培养过夜(约16小时)。
        自下一步骤起不需无菌操作
        2.取1ml菌液于1.5ml Eppendorf管中,3000r/min离心5分钟,弃去上清液,湿菌体在涡流混合器上振荡均匀。
        3.加入100ml溶液I,摇匀。冰浴10分钟。
        4.加入200ml溶液II,温和振荡,溶液变粘稠,而且清亮透明,冰浴10分钟。
        5.加入150ml溶液III,温和振荡,出现白色沉淀,冰浴10分钟。
        6.4℃ 10,000r/min离心10分钟,将上清液小心倒入另一个新Eppendorf管中,加入800ml预冷的无水乙醇。-20℃冰箱中放置1小时,沉淀DNA。
        7.4℃ 10,000r/min离心10分钟,弃去上清液,将Eppendorf管中所有液体挥发干净。
        8.加入20ml TE缓冲液溶解DNA。 

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