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用PCR-SSCP 区分不同来源的幽门螺杆菌
作者:未知 来源:本站原创 时间:2005-12-2


      幽门螺杆菌(Hp)感染在人群中广泛存在,Hp的分型鉴定对其感染的临床及流行病学研究具有重要意义。国外文献报道的几种基因型技术使Hp的分型鉴定成为可能,而PCR及单链构象多态性(Signle-strand conformation polymorphisms,SSCP)分析在菌株分型鉴定中的应用则尚未见报道。作者采用PCR-SSCP分析区分不同来源的Hp,并探讨其应用价值。

      1 材料和方法

      1.1 菌株来源 Hp标准菌株NCTC11637NCTC11848来自英国伦敦国家标准培养物收藏中心,由本院传染科保存并提供;112株临床分离鉴定的Hp来自97名因上胃肠症状在本院行胃镜检查的病人,经内镜及病理诊断证实十二指肠溃疡49例,胃溃疡5例,慢性胃炎43例。所有病人在内镜直视下于胃窦取粘膜活组织一块做细菌培养,其中包括1例未经治疗相融8个月复查胃镜者,4名病人还另于胃底或十二指肠球部取粘膜活组织一块做细菌培养,10例十二指肠溃疡伴Hp感染者于抗生素治疗停药4周复查胃镜,取胃窦粘膜活组织两块分别做细菌培养及PCR方法直接检测Hp

      1.2 模板DNA的准备 培养细菌或研碎的活检胃粘膜以1%SDS100μg/ml蛋白酶k55°C消化1h,以等体积苯本分氯仿-异戊醇(25:24:1)抽提,12000rpm离心10,吸取上层水相,加2.5倍体积冷无水乙醇12000rpm离心10min沉淀DNA,以100μl无离子溶解DNA1μl用于PCR扩增。

      1.3 PCR扩增Hp基因组 DNA203bp片段PCR引物CAM-2:5-CATCTTGTTA-GAGGGATTGG-3CAM-4:5-TAA-CAAAAAGATAATGGCGC-3’,已证实对HpDNA特异,扩增片段长度为203bp50μl10mMTris(pH8.3),50mM KCL,1.5mM Mgcl2,0.01%明胶,各200μdNTP,各0.5μM CAM-2/CAM-4引物,1.25U TaqDNA聚合酶(中科院遗传所产品)。反应条件:94°C5min,1个循环;94°C1min,55°C1min,72°C1.5min,35个循环;72°C10min1个循环。以HpNCTC11637DNA为阳性对照,去离子水做阴性对照。

      1.4 PCR产物的SSCP分析 PCR产物2μl0.1M NaOH 2mM EDTA37°C变性10min,3μl电泳加样缓冲液(95%甲酰胺、0.5×TBE0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯腈蓝)混匀,于7.5%聚丙烯酰胺胶室温电泳300V3.5min,以0.19%硝酸银染色30min,经显色液(1.5%NaOH,0.5%甲醛,0.0085%硼氰化钠)显色后观察结果,比较不同Hp菌株两条单链DNA片段的迁移情况。

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