促进PCR的添加剂
退火温度,引物设计和镁离子浓度的优化足以对大多数模板进行高特异性的扩增,但是,某些模板,包括高GC含量的模板,需要其他的措施。影响DNA熔解温度的添加剂提供了提高产物特异性和产量的另外一种方法(图22)。为获得最好的结果需要模板的完全变性。另外,二级结构会阻止引物结合和酶的延伸。PCR添加剂,包括甲酰胺,DMSO,甘油,甜菜碱以及PCRx Enhancer Solution可以增强扩增。它们可能的机理是降低熔解温度,从而有助于引物退火并辅助DNA聚合酶延伸通过二级结构区。PCRx Solution还有其他优点。在同Platinum Taq DNA聚合酶(图22)和Platinum Pfx DNA聚合酶一起使用时,基本上不需要优化镁离子浓度。这样,将Platinum技术同添加剂结合,增强了特异性,同时减少了第三种方法-镁离子优化的依赖。为获得最佳结果,应优化添加剂的浓度(图23),尤其是会抑制Taq DNA聚合酶的DMSO,甲酰胺和甘油。
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| 图22. 使用PCRx Enhancer Solution提高特异性 |
| 使用Platinum® Taq DNA聚合酶,由100ng人基因组DNA扩增一条156bp的片段(GC含量62%)。使用标准PCR缓冲液(A组)或带有1×PCRx Enhancer Solution的PCRx Amplificaton Buufer(B组),测试不同的MgCl2浓度(泳道1到4分别为1.0,1.5,2.0,2.5mM)。循环在94℃ 30秒,60℃ 30秒,68℃ 1分钟进行35个循环。 |
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| 图23. 测试PCRx Enhancer Solution的不同浓度 |
| 在带有不同量PCRx Enhancer Solution(0到4×)的1×PCRx Amplificaton Buufer中,使用Platinum® Taq DNA聚合酶,对包含三核苷重复的149bp序列(GC含量78%)进行扩增。 |




