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基因芯片技术知识概要
作者:张发宝 来源:本站原创 时间:2005-11-30

     

    国内外基因芯片生产情况

    美国继开展人类基因组计划以后,于1998年正式启动基因芯片计划,美国国立卫生部、能源部、商业部、司法部、国防部、中央情报局等均参与了此项目。同时斯坦福大学、麻省理工学院及部分国立实验室如Argonne Oakridge也参与了该项目的研究和开发。英国剑桥大学、欧亚公司正在从事该领域的研究。世界大型制药公司尤其对基因芯片技术用于基因多态性、疾病相关性、基因药物开发和合成或天然药物筛选等领域感兴趣,都已建立了或正在建立自己的芯片设备和技术。目前全世界有几百家基因芯片公司,有多种生物芯片问世,而且这些芯片的特点较以前密度更高,检测方法更精确,特异性更强的特点。而主要仍以少数几家公司为主,如AffymetrixBraxHysep等。国内目前主要如清华大学(陈京)、中科院生命科学院、上海复旦大学、北京军事科学院、南京东南大学、西安等四十余家公司,而且可能还有一大批公司相继成立。

    主要DNA芯片高科技术企业的开发善和各自技术特点(1998)[43]

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    公司

    排阵方法

    结果读出

    主要方向

    Affymetrix(Santa Clara,CA)

    单片照相平板印刷法在1.25cm25.25cm2薄硅片上合成2025mer寡核苷酸

    荧光

    表达谱,多态性分析,诊断

    Brax(Cambridge,UK)

    短合成寡核苷酸,离片合成

    质谱仪

    表达谱,新基因鉴定,诊断

    Hysep(Sunnyvale,CA)

    5002000ntDNA样品打印在0.6cm2(HyGnostics)或~18cm2(Gene Discovery)的膜上 预制5mer寡核苷酸在玻璃上打印或1.15cm2阵列(HyChip)

    放射性同位素

    荧光

    表达谱,新基因鉴定,诊断(HyGnostics/ HyChip Array
    多态性分析,大规模测序(Gene Discovery Array),大样品测序(HyChip Array

    Incyte Pharmaceuticals(Palo,Alto,CA)

    喷墨式打印PCR片段和在片合成

    荧光和放射性同位素

     

    表达谱,多态性分析,诊断

    Molecular Dynamics(Sunnyvale,CA)

    笔式捞钱5005000nt cDNAs于玻璃片上~10cm2`

    荧光

    表达谱,新基因鉴定

    Nanogen (San Diego,CA)

    电活性点捕捉预制的~20mer寡核苷酸到1cm2硅膜薄片上

    荧光

    诊断短片段串联重复序列鉴定

    Protogene Laboratories (Palo,Alto,CA)

    通过打印表面张力阵列在片合成4050mer寡核苷酸于9cm2玻璃片上

    荧光

    表达谱,多态性分析

    Sequenom(Hamburg,Germany and San Diego,CA)

     背面蹭脏胶印法阵列;2025mer

    质谱仪

    新基因鉴定,侯选基因确证,诊断,作图

    Synteri(Fremont,CA)

    5005000nt cDNA打印下于~4cm2玻璃片上

    荧光

    表达谱,新基因鉴定

    German Cancer Instiute(Hedelberg,Germany)

    f-moct-moc化学在片(原型PNA巨片)合成

    荧光/质谱仪

    表达谱/诊断

     

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