M. 100bp ladder marker 1. F.avelutipes 2. P.geesteyanus.Singer 3 .P.comucopiae 4 .P.eryngii 5 .A.cylindraca maire 6 .A.bisporus 7 .A.blazie 8 .P.sajur-caju 9 .R. vinosa Lindbe 10 .V. volvacea 11 .L. edodes 12 .D. indusiata 13 .G.lucidum 14 .spore of G.lucidum 15 .A.auricula 16 .T.fuciformis Berk C. Control(DD water)
3 讨论
3.1 紫外检测的结果与DNA的质量的关系
对于食（药）用菌DNA紫外检测的不正常结果，我们同时用CTAB法做了大肠杆菌的6个菌株的DNA提取作为比较，结果如表1所示，6个菌株的OD260/280均在1.9-2.0之间，OD260/230均在2.3-2.5之间，浓度也相当的高。可见，本文提取到的食（药）用菌DNA质量均较差，纯度不高，杂质多，量少。从草菇的提取情况来看，DNA质量的数值也差于草菇的研究[1]中CTAB法得出的结果。在提取过程中我们发现黑木耳、白木耳特别粘稠，即使加入了酚：氯仿：异戊醇以后，也难以得到清液，灵芝孢子、香菇、双孢蘑菇、杏鲍菇、红菇、秀珍菇、小平菇、姬松茸、竹荪、金针菇、凤尾菇和草菇均有不同程度的白色粘性沉淀，这是因为食（药）用菌中含有大量的多糖造成的。减少样品量，如较方法中的减半甚至更少，裂解时间延长甚至过夜，效果会好些。
表1 CTAB法提取大肠杆菌6个菌株的基因组DNA的紫外检测结果
|
序号 |
OD260/280值 |
OD260/230值 |
得率（ μg/ml ） |
|
1 |
1.944 |
2.436 |
1944 |
|
2 |
1.931 |
2.313 |
1533 |
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3 |
1.904 |
2.349 |
1551 |
|
4 |
1.920 |
2.278 |
1824 |
|
5 |
1.994 |
2.301 |
1015 |
|
6 |
1.942 |
2.376 |
3327 |
本文所使用的QIAGEN试剂盒说明书中有提到可专门用于真菌DNA的提取，在本研究中发现应用该试剂盒提取到的DNA在OD260/230上优于其它2种方法，说明蛋白及小分子物质污染会小些。
3.2 电泳检测的结果与DNA的质量的关系
根据电泳检测的原理，它可以检测到小至10ng的量[14]，这说明本研究提取到的DNA的浓度很低。同时我们注意到，电泳结果与紫外检测结果并没有一致性，所以我们推测电泳检测到的条带未必完全是DNA，因为其它物质如多糖也能与EB结合并发出荧光。
