Due to all the value of UV spectrophotometer detection in this study were always abnormal, we did a comparison with the same CTAB method on E. coli , results showed the value of DNA from E. coli were all good. And agarose electrophoresis could not be applied to all of the fungi, we had to select RAPD to analyze the DNA for PCR. How to improve the extraction method to gain high quality DNA from edulis and medicinal fungus and if there was the better method specially for analyzing them, still needed further studies.
食(药)用菌作为健康食品极受人们的欢迎,尤其近年来,随着人们生活水平的提高,更是受到消费者的青睐。食(药)用菌是我国传统的特色农产品,我国是食(药)用菌生产和消费大国,同时又是食(药)用菌出口大国。随着市场需求的增加以及我国政府的重视,食(药)用菌的生产量和出口量都在不断扩大。
一段时间以来,我们发现一些国家,尤其是阿拉伯国家,对我国的食(药)用菌出口提出了转基因成分检测的要求,他们只接受非转基因食(药)用菌,这个现象给我们提出了新的课题。首先,食(药)用菌属于大型真菌,外形上象高等植物,结构上却不同于高等植物,它的DNA提取比较困难。关于食(药)用菌DNA提取方面已经有了一些报道,包括草菇[1],金杂和草菇[2],香菇、蘑菇、平菇、红芝[3]等少数几种食用菌DNA的提取方面的研究,但对多数常见食(药)用菌进行专门的DNA提取方法进行研究比较以及对提取到的DNA进行分析比较,还未见报道。为了比较全面探讨出口食(药)用菌的转基因成分检测方法,结合我们检测工作的实际情况,本研究选用了常见的15种食(药)用菌进行3种DNA提取方法的研究比较。
1. 材料与方法
1.1 食(药)用菌
包括小平菇Pleurotu comucopiae、草菇Volvariella volvacea、凤尾菇Pleurotus sajur-caju、茶树菇Agrocybe cylindraca maire、灵芝Ganoderma lucidum、红菇Russula vinosa Lindbe、杏鲍菇Pleurotus eryngii、香菇Lentinus edodes、双孢蘑菇Agaricus bisporus、竹荪 Dictyophora indusiata、灵芝孢子spore of Ganoderma lucidum、白木耳Tremella fuciformis Berk、黑木耳Auricularia auricula、金针菇Flammulina velutipes、秀珍菇 Pleurotus geesteyanus.Singer、姬松茸Agaricus blazie等15种(以下只用中文名称),原料来自3个途径:包括福州各大超市,如好又多、麦德龙等;食(药)用菌商家,如灵芝和灵芝孢子由圣灵公司提供以及出口企业送检样品。
1.2 试剂药品
分子生物学试剂主要购自上海生工生物工程公司,试剂盒Dneasy Mini kit(50)(cat. No. 69104/69103)为德国Qiagen公司开发,食品DNA提取试剂盒为北京陆桥技术有限责任公司开发。其它常用试剂均为国产分析纯。
1.3 DNA提取方法
CTAB法:样品烘干后,研磨成粉,称取0.05g,加600μL CTAB缓冲液[20g·L-1 CTAB,0.1mol·L-1 Tris-HCl(pH8.0),20mmol·L-1 EDTA(pH8.0),3μL蛋白酶K(20mg·mL-1),3μL RNaseA(10mg·mL-1)],振荡混匀,65℃温浴2个小时以上或过夜,期间定期晃动。加500μL酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),振荡混匀,12,000r·min-1离心10min。取上清,加等体积氯仿:异戊醇(24:1),振荡混匀,12,000 r·min-1离心10min。取上清,加0.8倍体积异丙醇,混匀,12,000 r·min-1离心10min。取沉淀,加350μL NaCl(1mol/L)溶解,加350μL氯仿:异戊醇(24:1),振荡,12,000 r·min-1离心10min。取上清,加0.8倍体积异丙醇,12,000 r·min-1离心10min。取沉淀,70%乙醇清洗2次,干燥,加100μL TE(pH8.0)溶解。
Qiagen试剂盒法、食品DNA试剂盒法:参照试剂盒说明书进行。
1.4 DNA 吸光值测定
DNA经100倍稀释后,于紫外可见分光光度计(安玛西亚公司,ultrospec 1100 pro型号)上测定其浓度和纯度。


