2.方法Ⅱ
硝酸纤维素滤膜上的RNA也可以用下述方法染色:从干烤后的硝酸纤维素滤膜上剪下所需的条带进行染色,也可以用经过杂交并经X光片曝光后的整张滤膜进行染色(A.Efstratiadis,未了表材料)。
1)将干燥的滤膜浸入5%冰乙酸中,于室温浸泡15分钟。
2)再将滤膜转移至0.5mol/L乙酸钠(pH5.2)、0.04%亚甲蓝溶液中, 于室温浸泡5-10分钟。
3)用水淋洗滤膜5-10分钟后,可见RNA分子量标准参照物带型锐利而poly(A)+mRNA为一模糊带型,由许多长度范围从500碱基以下至5kb以上的各种mRNA共同组成,mRNA的平均长度约为2kb。
杂交和放射自显影
固定于滤膜上的RNA的预杂交、杂胶及淋洗等条件,与DNA杂交的相应条件基本相同。现简述如下1)用下列两种溶液之一进行预杂交,时间1-2小时。若于42℃进行,应采用。
50%甲酰胺
5xSSPE
2xDenhardt试剂
0.1%SDS
若于68℃进行,应采用:
6xSSC
2xDenhardt试剂
0.1%SDS
2)在预杂交液中加入变性的放射性标记探针,如欲检测低丰度mRNA, 所用探针的量至少为0.1μg,其放射性比活度应大于2x108计数/(分.μg)在适宜的温度条件下继续温育16-24小时。切记RNA只与双链DNA中一条单链互补,因此如用单链探针, 则必须是能与RNA互补的一条单链。
3)用1xSSC、0.1%SDS于室温洗漠20分钟, 随后用0.2xSSX、 0.1%SDS于68℃洗膜3次每次20分钟。
4)用X光片(Kodak XAR-2或与之相当的产品)进行放射自显影, 附加增感屏于-17℃曝光24-48小时。

