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分子生物学实验基础知识简介
作者:未知 来源:思想者学术资源论坛 时间:2005-8-4

    表18-1 探针标记及特性

    标记物 检测方法 特点
    32P β射线,自显影 灵敏度最高,半寿期14天,放射强度1.7MeV
    35S β射线,自显影 灵敏度高,分辨率好,半寿期87天,0.17MeV
    3H β射线,自显影 低敏度高,分辨率高,半寿期12年,0.01MeV
    125I γ射线,自显影 灵敏度高,分辨率高,半寿期60天,0.04MeV
    生物素 酶标血凝素,显色 灵敏度好,避免有内源性生物素标本
    地高辛 酶标地高辛配体,显色 灵敏度好,分辨率一般
    T-T二聚体 酶标抗二聚体抗体,显色 灵敏度好,紫外照射形成二聚体而标记
    BrdU 酶标抗BrdU抗体,显色 灵敏度好,细菌内含质粒复制掺入
    铕-补骨脂素 荧光 灵敏度一般

      缺口平移标记法先由DNase Ⅰ在DNA双链上切出随机切口,DNA聚合酶Ⅰ沿缺口水解5′端核苷酸和3′端修复加入被标记核苷酸同时进行,切口平行推移,可均一标记DNA链。(图18-4、5)

      缺口平移法快速、简便、成本相对较低、比活性较高、标记均一。主要利用了DNA聚合酶Ⅰ修复DNA的功能,用于大分子DNA标记(>1000bp最好),单链DNA、RNA不能用该法标记。随机引物法具有上述优点,可代替缺口平移法。此外大小、单双DNA均可标记,标记均匀,标记率高,但不能标记环状DNA。利用末端转移酶可进行“尾标”,尾标适用于寡核苷酸探针标记,用于大分子核酸标记因尾巴短而标记比活性降低。尾标不能用dTTP标记,因mRNA的多聚(A)尾而影响杂交特异性。寡核苷酸探针多用于核酸“点”突变检测,该探针可用核酸合成仪人工合成。克隆探针一般较长,特异性

    图18-5 DNA随机引物标记法

      好,标记量大,杂交检出信号强。合成探针长度短,一般在20-50核苷酸之间,过长合成成本高,且易出现聚合酶合成错误,杂交时间长。太短则特异性下降。合成探针设计还应注意碱基组成G≡C含40%-60%,一种碱基连续重复不超过4个,以免非特异性杂交产生。还要注意探针自身序列内应无互补区域以免产生“发夹”结构,影响杂交。一个好的探针最终在实践中才能加以确认。另外,还有利用M13噬菌体载体可复制单链DNA的特点,复制合成DNA探针,利用转录载体(DNA),转录合成RNA探针。下面就GIBCo BRL公司(Bethesda Research Laboratories美国)的缺口平移法标记生物素试剂盒(bionick labeling system)为例介绍如下:

    试剂: 10x dNTP Mix.250μl 10x Enzyme Mix 250μl
      0.2mmol/L each dCTP,dCTP,dTTP 0.5 units/μl DNA Polymerase Ⅰ
      0.1mmol/L dATP 0.0075 units/μl DNase Ⅰ
      0.1mmol/L biotin-14-dATP 50mmol/L Tris-HCl(pH7.5)
      500mmol/L Tris-HCl(pH7.8) 5mmol/L magnesium acetate
      50mmol/L MgCl2  1mmol/L β-mercaptoethanol
      100mmol/L β-mercaptoethanol 0.1mmol/L phenylmethyl-
        sulfonyl fluoride
         
      100μg/ml nuclease-free BSA 50%(v/v)glycerol
        100μg/ml nuclease-free BSA
       Control DNA:5μg pBR322 in TE  
      stop buffer 300 mM EDTA  
      autoclaved H2O  

      操作步骤:

      将5μl 10x dNTP Mix.;-μl DNA(相当1μg需标记的DNA量);-μl灭菌蒸馏水加至45μl;再加5μl 10x Enzyme Mix.依次加入1.5-2ml离心管后。15000xg离心15秒钟。16℃保温1小时。加5μl Stop Buffer终止反应。乙醇沉淀,备用。

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