4.电泳和放射自显影
(1)配制6%变性聚丙烯酰胺凝胶,灌注测序板。
(2)预电泳30min。
(3)每个dd-PCR反应取出5μl于一新微量离心管中,加5μl loading
buffer,混匀,离心,置94℃变性2min。立即置冰浴。
(4)停止预电泳,冲洗加样孔。
(5)加样2μl。70W电泳2.75hr至二甲苯青到达胶的底部。
(6)下胶:(同测序胶)
(7)干胶:在胶表面覆上保鲜膜,80℃干胶30min。
(8)X光片-70℃曝光过夜或更长时间(根据射线强度而定)。
图2-6显示了dd-PCR放射自显影的X光片
5.差异条带回收再扩增
(1)X光片经D72显影、酸性定影液定影后,水洗晾干。置X光片灯上比较寻找差异条带。
(1) 用一次性手术刀片在胶上切割差异条带,加ddH2O 20μl,沸水浴15min,离心取上清为模板。
(3) 以原引物扩增:
回收DNA 7 μl
10×PCR buffer 5 μl
5mM dNTPmix 0.5 μl
引物P 2.5 μl
引物T 2.5 μl
Taq酶 2 μl
加ddH2O至总体积为50μl
(4) 执行PCR程序:
93℃3min;93℃1min→60℃1min→68℃2min,20次循环;68℃5min。
(5) 取PCR产物10μl 2%琼脂糖电泳检测。
(6) PCR产物乙醇沉淀,10μlddH2O溶解。
6.以PCR产物为探针,标记后进行Northern杂交,证实基因的真实性。
7.PCR产物的TA克隆。
8.DNA序列测定。
9.检索分析。


