（三）否定师徒传承的传统培养模式，纯正中医后继乏人
以师带徒、师徒传承是我国中医人才培养的传统模式，几千年来造就了一大批受群众欢迎和爱戴的名医。但现行医疗制度与政策，基本否定了师徒传承模式，甚至使其无容身立足之地。
中国讲究师徒传承。迄今，戏剧、国画、相声、书法、武术等等仍在提倡拜师，为什么中医不能拜师学艺？许多东西“不可言传，只可心授”，故自古师徒如父子，自当尽心传授。西方研究生制度重经济利益轻师生情感，真知绝活难以直接传承。现今的中医教育、职称和执业资格制度，导致真正中医越来越少，今后可能就会像日本那样，不再有真正中医了。解放前留下来的全国著名老中医已所剩无几，且均已70岁以上高龄；50年代以传统方式培养的国内知名中医大夫已为数不多，也已年近古稀；其后主要按西医式教育培养的中医，在传统中医上有真正成就者、知名者甚寡。纯正中医后继乏人已成严重问题。
（四）按西医医院方式管理中医医院，中医已无真正的临床基地
目前全国大小中医院虽有近2500家，但基本上全是中西医“结合”医院，已经没有真正传统的中医医院。一则，查病主要靠西医仪器来检测与化验；二则，断病主要靠化验单的数据来判定；三则，处方主要按西医思维与理论来开方治病，四则，抓药是中药西药并用，中药西药为主互见；五则，验效主要靠西医仪器来检验治疗效果。因此，现行中医医院已经难以称为真正中医临床基地了，也没有多少中医大夫真正能按中医思维看病了。甘肃天水中医院从德国贷款1000多万欧元购买德国医疗设备，还美其名曰“中医现代化”。难怪有人说如今三级甲等的中医院，充其量是一个二流的西医院。
之所以如此，是由于中医大夫靠卖脑子开处方养活不了自己。所以针灸在国外开花，而在国内衰败。因为针灸大夫赚不到钱，许多医院撤消了针灸科。
（五）以西医标准评判中医，贬低甚至否认中医成果
中医西医本是两个不同的理论与实践体系，其临床方法与评判标准基本无法兼容。但中医得不到现行医疗理念与制度的基本承认，中医的诊病治病与验效，中药新药的开发、评审与推广，大都采用西医标准来判定。将西医作为唯一标准，不承认中医临床“实践标准”，硬要由西医认可中医疗效才算。
如1956年石家庄用中医治疗乙脑，疗效奇佳，且无后遗症，但当时的卫生部不予承认。1957年蒲辅周一人成功治疗乙脑167人，主管部门却以其使用了多达98组中药处方，没有规范的统计学意义，不承认其疗效。近的如刘海若，英国两次宣布其“脑死亡”，回国后，中医辨证论治，采用方药、针灸、按摩等手段综合治疗，效果显著。但对外宣传开始根本不提中医，后迫于压力又说是“中西医结合”的成果。试想，若说中国的西医治好的，外国人相信吗？难道中国的西医比英国的水平还高？
最为典型的是这次抗击SARS。广州中医药大学附属医院采用中医药治疗SARS，效果非常显著，但在相当一段时间里得不到承认，更得不到及时推广。今年4月，广州中医专家应科技部徐部长之邀，向SARS科技攻关组介绍治疗SARS的经验，一些权威人士说：“你们要拿出一个规范性的东西，和西医进行对比，如果证明确实有疗效，我们再组织推广”，“没有与西医对比，说明不了问题”。这犹如三国时诸位将军屡败于华雄而仍瞧不起布衣关羽一样。西医虽然明知抗生素、激素等西药杀不死SARS病毒，且副作用极大，却可名正言顺在病人身上进行超大剂量试验，美其名曰是治疗：被西药治好的人，今天近半数已开始出现股骨头坏死。
（六）片面理解中药现代化，中药科研走向废医存药
中药现代化的提法是正确的，但如何现代化却是一个非常严肃的问题。从中药现代化多年的实施过程来看，基本的思路和做法是要与国际接轨，想按西医的科研思路与标准，搞清中药的化学成分，提取有效物质，制成类似西药的治疗某种病的“新型中药”。这完全是研究开发新西药的方法，若借以从中药中开发出新西药是无可非议的，若将其作为中药现代化的主要甚至唯一途径，其结果不是中药现代化，而是中药西化，必然导致废医存药，最后连中药也将不复存在。
如，中药现代化研究的“王牌”成果“青蒿素”，通过有效成分提纯后，已不具备中药的四气五味、归经等性能，已不能参与中药处方的配伍了，就是说已不再是中药，与黄连素、麻黄素等植物药提取物一样，早已归于西药范畴。其实，国外炒做的龙胆泻肝丸事件就是中药成分化的结果，是辨病使用中药或将中药当食品长期过量食用的结果。一些人不遵守中医“药之害在医不在药”之理念，盲目修改《约典》中龙胆泻肝丸处方，必然导致恶劣影响。
按照现行中药现代化的片面做法，即主要针对西医病名并按西医理论进行实验来开发中药新药，根本就不可能开发出像六味地黄丸这样的名方成药来。因为六味地黄丸并不专治某一种病，而是须在中医理论指导下，针对肾阴虚之证使用，其应用范围很广，疗效也极为显著。据统计，用六味地黄丸治好的病有430多种，但若按西医病名使用，什么病也治不了。所以，中药研究寻找有效成分、走简单模仿西药的道路是走不通的。打个比喻，解放军中谁起的作用最大，毛主席，但仅由毛主席组成解放军是不成的。
三、中医药陷入困境的主要原因
中医药学是中华民族5000年得以繁衍昌盛的重要基础，是伟大、优秀的中华民族优秀文化的最重要组成部分之一。中国现存古籍中，1/3是医籍。现今中医药地位低下甚至陷入困境，既有认识问题，有制度问题，也有中医自身问题。
