四、不合理的税收
目前在国家税收体制中，存在着严重制约中小型高新技术企业发展的问题。
首先，增值税不利于中小型企业发展，更不利于中小型高新技术企业发展。众所周知，高新技术企业具有高风险高回报的特点。高风险的原因有二。其一是研究开发投入大，其二是技术更新变化快。因此决定了高新技术企业的高风险性。无疑，增值税“有效”地加大了高新技术企业的风险。如同釜底抽薪，不断地抽走高新技术企业的流动资金，加大了其运转困境。
高新技术企业的另一个特点是无形资产远远大于其有形资产，因此其发展得越快其流动资金的需求量就越大，而目前靠无形资产无法从银行贷到流动资金，因为无形资产不能进行抵押。因此增值税对这样的企业来说可以说是雪上加霜。
其次，工资不能计入生产成本用于减免增值税同样制约了中小型高新技术企业的发展。
高新技术企业的另一个特色是人才、智力高度密集。人力成本在总成本中占有较高比例，尤其是企业在未发展成规模的早期阶段。工资不能计入成本进行增值税的抵扣是明显不合理的。
五、缺少完整的信誉和贷款系统
目前在我国，存在许多贷款后不还的现象。缺少完整的信誉系统已成为阻碍中国产业发展的严重问题。如何建立完善的信誉系统，是一个很重要的问题。
六、如何促进民间资本进入风险投资和私募资金
西方发达国家为了刺激民间资本进入风险投资，制订了许多相应政策，如：如果个人投资高新技术产业，因为有高风险，那么这笔投入如果得到了收益，政府将对此收益免征所得税。对于这一点，我国政府是否也应有所考虑。
七、人才的个人所得税偏高
个人所得税的目的是调节社会收入，保障社会稳定，但目前的个人所得税不适应我国现阶段的发展国情。所得税门坎太低，比重太高，直接影响高素质人才的积极性。随着中国进一步开放，高素质人才将更多地在全球流动，如果在中国他（她）们觉得所作出的贡献与所得到的回报不相符，他（她）们就会流向别的国家和地区。
八、对知识产权的保护有待加强
对知识产权的保护，不但关系到保护创新、保护研究与开发积极性的问题，还关系到创新与研发的可持续性进行的问题。知识产权的被盗用，必然会造成一种核心技术为大家所共同拥有，企业为了生存在市场上相互压价，进行不正当竞争，最终造成每一家企业都利润不足，没有钱投入新的研发，由此势必会造成恶性循环。
此外，我国生物技术产业还面临缺少相应的政策来刺激创新、刺激研究与开发的问题。
以上9个问题如果得到解决，我国的生物技术产业的发展就会实现腾飞，按照前不久泰达华生生物技术及医药国际研讨会上，诺贝尔生理及医学奖评委会主席Jan-Ake Gustafsson的说法，中国在10年之内有望问鼎诺贝尔奖。
生物技术产业必将为人类经济和生活带来深远影响，这个产业在人类生活中所涉及领域之广，涉及层面之深是之前任何产业无法比拟的。生物技术产业目前正在全世界面临腾飞，中国能否抓住这次机遇，不但关系到国家经济的发展，更关系到中华民族的伟大复兴能否实现。
