生物制药工业的蓬勃发展有目共睹。但在当前红火的形式下，其未来的可持续发展能力受到质疑。症结就是资金和发展原动力。
传统的股市圈钱不可靠
生物制药公司，尤其是中小型公司和新兴公司，正逐渐失去传统资金来源的支持。而这一点往往被大型生物制药公司的成功所掩盖。生物制药企业必须明白，传统的股市圈钱已经越来越不可靠了。
尽管基因泰克公司2005年依靠癌症药物飞速发展，股票价格几乎翻了一番，但美国证交所的生物指数始终没有上升。在过去的两年内，上市的生物技术公司的股价平均下降了７％。这多少说明了股市对生物技术制药公司越来越缺乏兴趣，因而，生物制药公司必须认识到，资金来源已经不能单纯指望股市上的公开交易了。
另一方面，风险投资人手中聚集的资金总量仍然充裕，只是他们对投资对象更加挑剔。只有那些到了“晚期”的公司（即拥有已经成熟的制剂，随时可以完成临床试验、向FDA提出上市申请的公司）才可能获得青睐。因为只有这样的公司，才能在可见的未来中看到赢利的可能。
生物制药企业必须明白，传统的股市圈钱已经越来越不可靠了。现在，生物制药企业必须摆脱对股市的向往，因为股市如果将钱投资给生物科技股，多少就意味着有“赚快钱”的想法。现在，投资人持币观望，试图寻找下一个基因泰克公司，而不是想轻易投资给一家没有名气、没有成型产品、甚至没有像样临床试验基础的生物科技企业。这样的局面事实上也是最近几年来成功的生物技术公司给投资者带来的暴利所诱导的——大量的投资人血本无归，少数人却获得了巨大的利润。
创新热情被压抑
在上世纪90年代，风险投资掏宝似地收集着各种生物技术公司，一遍遍筛选从而获得最终成功的企业——这也是生物制药行业迄今为止发展良好的重要保证，现在成功的生物制药企业都是在那时得到了资金支持和信任。但现在不行了，众多新兴生物公司无声息地在资本匮乏中死亡，带走了技术和科技方向。
从失眠药物，到多发性硬化症药物，或是新陈代谢促进药、癌症药，生物制药似乎可以在医药制剂的任何领域开辟新型治疗手段。可以说，生物制药企业几乎成为近年来整个制药工业创新的原动力。
但是，这个行业的财务危机已经逐渐展现出来。对处于初始阶段的生物科技公司而言，资金短缺已经严重地影响了他们的创新能力，连带着新药新治疗方法的市场化推出速度越来越慢，品种越来越少。
