作为一项高技术产业，生物技术的发展离不开风险投资的支持，发育完善的资本市场是生物技术产业持续、蓬勃发展的关键因素，没有资本市场的孵育，这一高技术就只不过是积压在实验室内的一堆成果而已，利润驱动下的资本流动使得成熟生物技术成果的产业化成为可能。所以，研究跟踪生物技术产业不能不跟踪其资本市场的动态情况。
生物技术资本市场主要包括三部分，第一部分是非上市公司市场，主要的融资方式为股权投资（Equity Investment），其中以从事未上市公司股权投资的风险资本也扮演主要角色；第二为首次公开发行市场，即IPO市场，融资方式为承销、包销，基本上由投资银行、券商和对冲基金（Hedge Fund）在其中主导整体市场运作；第三部分是证券流通市场，主要融资形式包含Follow-on（也称Secondary Offering）、PIPEs和债券等等，主要由共同基金业（Mutual Fund）主导掌控。从全球趋势观察，近年来由于对冲基金规模日益扩大，为寻找新的投资目标已经开始进入首次公开发行市场，成为IPO的重要角色，甚至也逐渐向未上市股权投资渗透；很多迹象显示从2003年开始，生物技术资本市场上的对冲基金进入数量越来越多。
2003年生物技术公司实现融资额169.27亿美元，其中合伙人的股权转卖和风险投资占主要部分。见下图。近年来生物技术的融资情况，可以概括为以下几点——
（一）整体投资形势开始复苏
分析1998-2003年生物技术产业的融资金额可见（见下图），2000年达到一个峰值之后，生物技术的融资重新回落到一个稳定的发展阶段。在高技术资本市场上，资本的投入方向不外乎信息技术和生物技术产业两大主流方向，它们作为最具发展前景的高技术产业，在资本市场上的融资情况基本上反映了业界对它们的发展期望值。1999年底网络泡沫破灭以后，生物技术，尤其是生物制药成为投资者的新宠，“生物技术即将迎来高成长期”成为投资者的共识，尤其是2000年2月人类基因组计划的研究结果公布更是为这一共识注入了强心剂，全球资本纷纷转向涌向生物基因与信息技术结合的生物信息学概念，造就了2000年前半年生物技术融资达到前所未有的高峰。
但是，资本的本质是趋利的，寻求快速回报是投资的本质。2000年以后，人类基因组计划并未为投资者带来丰厚的回报，生物技术对资本的吸引力在2001年立即下跌，这一下跌持续到2002年。
2002年，美国生物技术类股票陷入低谷， AMEX生物技术指数由年初571点一路下滑，年中后持续游移在300-400点间，跌幅最高曾至42%；Nasdaq生物技术指数（NBI）也惨跌46%，IPO则继续保持2001年的紧闭状态，全年仅有6家生物技术公司顺利实现IPO。在融资额上表现为从2000年的380亿美元大幅下滑到随后两年的151、105亿美元。
