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Bandscan PCR产物条带密度分析之简易操作手册

Bandscan PCR产物条带密度分析之简易操作手册

作者:很帅的老头
* J' t3 k+ Q. H& K  n1 X生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区软件下载地址:http://www.bbioo.com/Soft/2005/75.htm
+ l  {' K6 k7 S以PCR条带为例演示密度分析的简要流程,跟着做,就能得到相应数据
  G0 ?; p9 `+ n0 [生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区
# x' e! V  e& F! S  T! b" X# T1 Zwww.bbioo.com现在以以下图片为例进行数据分析全过程演示。
  D( A; G( }( V9 E+ r6 n6 x9 x这是原始jpg图片,截的RNA的28S,就当PCR产物看吧:生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区- S  N" n( i* v' n- q8 L
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不过数据分析时好象用TIF格式文件才好用。
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+ C) s6 B9 y* P, w1. 运行Bandscan程序,就是程序安装过程中创建的那个图标:
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+ C; w0 _5 g$ d1 B3 J' U$ f$ S生物秀论坛『中国生物科学论坛』2. 打开目标分析图像:
$ m- [7 w4 ?& D% H. o生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区; l( {1 }8 {' \; M3 K; ~" N. T
3.选择分析区域:
5 K5 |/ L" B4 R生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区生物秀论坛『中国生物科学论坛』+ b4 v  h2 u. F( s

  c3 F& p" c9 D- j6 T2 w, V$ }www.bbioo.com[ 本帖最后由 bio8848 于 2008-6-27 20:14 编辑 ]
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4.区域选定之后就会弹出所选择的图像:生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区. v, v) Y# E; S( o$ [
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( h0 C$ F+ A; F4 P: Q: [4 R; j# awww.bbioo.com5. 如果认可所选择的图像,那就ACCEPT吧:; L; L7 r0 y9 x+ ]) Y

$ b3 P) _2 B) V- C* s- f5 |仔细研究一下程序第三主菜单Band Finding的内容吧: D/ v/ L/ h. c) N  q7 p8 s5 L
6.Find Bands
  I7 I, m+ M9 T- V" j( E3 ^( X生物秀论坛『中国生物科学论坛』
) z  w# X4 X8 Y" S+ L9 Y3 ~生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区" _& X2 o" k" K, w
7.如果程序自动选择的条带区域不对,可以将它选择的del掉,手工插入band,俺就是这样做的:
; O0 r( W. @% K7 [' g" U) k9 ]生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区" c( r. y- F+ _$ o0 L& {' b) g  a  a
8. 数据分析:生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区0 e" x) T1 s4 p7 Z
就是第一主菜单中的第5子菜单--save banddata to file生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区1 L% {  U% r# D* O
这就是程序计算出来的总灰度值:生物秀论坛『中国生物科学论坛』( k' ~7 }# Y: @3 P

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  p7 {+ T5 {2 Q! Y生物论坛,生物秀论坛,中国生物科学论坛,中国生命科学论坛,生物社区,生命科学,学术交流,互助社区数据还算公正地反映出了条带的粗细吧!8 w% D8 C4 M% m$ G' q) b
接下来,就该你们自己玩了,千万不能玩出火O!www.bbioo.com4 s9 U2 v, k1 {9 P% G

. K; c6 I! r1 _3 q生物秀论坛『中国生物科学论坛』[ 本帖最后由 bio8848 于 2008-6-27 20:25 编辑 ]
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