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RNA 分析资源列表

◇ XRNA1.1.12b (生成、显示、注释RNA二级结构的软件)

基于java的生成、显示、注释RNA二级结构的软件，可很容易地编辑、修改、生成发表质量的RNA二级结构图。需要有JAVA语言环境软件JRE1.42软件，15M，及Java3D OpenGL API 1.3.1，4M，和Java Advanced Imaging 1.1.2，5.4M，方可以运行。XRNA is a Java based suite of tools for the creation

◇ Vienna RNA Package 1.64(RNA二级结构预测与比较软件)

维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包，全部下载共计5.8M。包括以下软件：RNAfold预测最小能量二级结构，并给出图像；RNAeval估算RNA二级结构的能量值；RNAheat计算一个RNA序列的融解曲线；RNAinverse预定结构的序列的反转折叠；RNAdistance比较二级结构；RNApdist比较碱基对的概率；RNAsubopt完善次优折叠。还有RNAalifold和RNAplot

◇ SStructView 1.2(RNA二级结构显示软件)

用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件，可嵌入到HTML中，用IE运行使用。a Java applet for viewing RNA secondary structures and linking to multiple computational backends. SStructView 1.2 is available. This version supports colored

◇ loopDloop 2.07b(绘制RNA二级结构的软件)

Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。loopDloop is a tool for drawing RNA secondary structures in molecular biology.loopDloop will read files that include biosequence data with base pairing information. I

◇ RnaViz 2.0(RNA二级结构图绘制程序)

界面友好的RNA二级结构图绘制程序。可生成发表质量的二级结构图，可显示一些特殊结构。需要安装Tcl 8.3.2 / ClassyTk1.0.exe。RnaViz is a user-friendly, portable, GUI program for producing publication-quality secondary structure drawings of RNA molecul

◇ RNAz 0.1.1

300K，预测结构保守热稳定RNA结构，可用于基因组中筛查功能RNA结构等等。原始网站。

◇ RnaFamily

java编写的用于显示一个RNA分子族的所有二级结构小软件，原始网站。

◇ pknotsRG 1.2

预测RNA二级结构软件，包括pseudoknots（假扭结）结构。原始网站

◇ Circles 0.1.0

使用比较的方法分析RNA二级结构软件，并以标准格式输出预测的二级结构。原始网站。

◇ RNAstructure 4.6（预测RNA二级结构软件） 4.2

4.2兆，Unix平台软件mfold的for Windows版本，输入或载入RNA的一级序列,根据最小自由能原理,依据一定算法,预测出其二级结构图，非常出色的一个程序。RNAstructure 3.2 中文帮助文件。 4K。原始网站。RNA Sturcture 是根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室

◇ RNA draw 汉化版

RNA draw 1.1b2 RNA二级结构分析软件,对RNA一级序列进行二级结构分析作图,最有意思的是大部分功能集中在鼠标右键。

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