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e-PCR 2.3.1
     
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    电子PCR — 将一个查询序列同已经定位的STSs比较,来发现查询序列的可能的图谱定位。E-PCR通过查找在的DNA序列中与定位标记的PCR引物非常吻合的子序列来找到STSs。这个子序列一定要有正确的顺序,方向,和间隔,以至他们可以合理的启动一个扩增出正确分子量的PCR产物。最新版本的e-PCR搜索除了NCBI dbSTS数据库以外的其他资源:1)人类:GDB,Genethon遗传图谱,GeneMap’99,Stanford G3图谱v2,Whitehead GB4图谱,Whitehead YAC图谱,NHGRI chr 7图谱,WUSTL chr X图谱,NCBI RH图谱,和2)小鼠:Whitehead遗传图谱,Whitehead RH图谱,Whitehead YAC图谱。e-PCR可以通过WWW查询,或可以从NCBI ftp站点的/pub/schuler/e-PCR目录下载。

    Electronic PCR (e-PCR) is computational procedure that is used to identify sequence tagged sites(STSs), within DNA sequences. e-PCR looks for potential STSs in DNA sequences by searching for subsequences that closely match the PCR primers and have the correct order, orientation, and spacing that could represent the PCR primers used to generate known STSs.

    电子克隆是一种电脑软件,用来识别DNA序列标签位点(STSs)。e-PCR软件为使用STS数据库匹配DNA序列。使用re-PCR是在序列数据库中匹配STS,使用famapfahash软件为生成re-PCR查找的序列数据库。

    原始网站:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/e-pcr/

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