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siRNA和miRNA专题知识
作者:未知 来源:本站原创 时间:2005-11-12

    miRNA介绍

        miRNA的研究起始于时序调控小RNA(stRNAs)。1993年,Lee等在秀丽新小杆线虫(Caenorhabditis elegan)中发现了第一个可时序调控胚胎后期发育的基因lin-4,2002年,Reinhart等又在线虫C.elegan中发现第二个异时性开关基因let-7,2001年10月《science》报道了三个实验室从线虫、果蝇和人体克隆的几十个类似C.elegan的lin-4的小RNA基因,称为microRNA。随后多个研究小组在包括人类、果蝇、植物等多种生物物种中鉴别出数百个miRNAs。对一部分miRNAs的研究分析提示:miRNAs参与生命过程中一系列的重要进程,包括发育进程,造血过程,器官形成,凋亡,细胞增殖,甚至是肿瘤发生(Kim, 2005)。

        miRNAs是一种21-25nt长的单链小分子RNA,其结构特征如下:广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列RNA,它本身不具有开放阅读框(ORF);成熟的miRNA,5′端有一个磷酸基团,3′端为羟基,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。成熟的miRNA 5’端的磷酸基团和3´端羟基则是它与相同长度的功能RNA降解片段的区分标志。miRNA独有的特征是其5'端第一个碱基对U有强烈的倾向性,而对G却有抗性,但第二到第四个碱基缺乏U,一般来讲,除第四个碱基外,其他位置碱基通常都缺乏C。MiRNAs具有高度的保守性、时序性和组织特异性。miRNAs的表达方式各不相同。线虫和果蝇当中的部分miRNA在各个发育阶段都有表达而且不分组织和细胞特性,而其他的miRNA则表现出更加严谨的时空表达模式(a more restricted spatial and temporal expression pattern)——只有在特定的时间、组织才会表达。细胞特异性或组织特异性是miRNA的表达的主要特点,又如拟南芥中的miR-171仅在其花序中高水平表达,在某些组织低水平表达,在茎、叶等组织中却无任何表达的迹象;20-24h的果蝇胚胎提取物中可发现miR-12,却找不到miR3-miR6,在成年果蝇中表达的miR-1和let-7也无法在果蝇胚胎中表达,这同时体现了miRNA的又一特点——基因表达时序性。MiRNA表达的时序性和组织特异性提示人们miRNA的分布可能决定组织和细胞的功能特异性,也可能参与了复杂的基因调控,对组织的发育起重要作用。

        在科研上,一个小RNA分子要成为miRNA,需要符合以下条件:a)表达需要用Northern-blot来证实;b)小RNA分子必须是处在具发夹结构的前体RNA分子中远离环或膨胀部分的一端才行;c)小RNA分子必须在系统发育上具备相当的保守性。d)前体RNA分子会在Dicer功能下降时积累起来(该项标准由于实践较难,只做参考)。这些标准单独一条不足以证明一个未知小RNA分子是否就是是miRNA,具体地,如果小RNA分子符合上面的a(表达)和b(结构)两条标准;或者a(表达)和c(保守性);如果表达量很低难以检测,那么如果可以用cDNA克隆的方法得到目标分子,并符合c(保守性);小RNA分子如果不是通过cDNA克隆的方法得到的,那么就必须符合a(表达)和前体RNA分子结构和保守性的标准才行;如果小RNA分子被推测为miRNA,那么符合c(系统发育保守性)和d(累积性)标准也行;这样我们就可以认为该小RNA分子就是miRNA分子。

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